S'agissant de la faune, la réserve de Scandola constitue le lieu de vie ou de séjour de nombreux oiseaux. Construisant ses nids sur le sommet des pics rocheux, le balbuzard, bel aigle pêcheur, que l'on ne peut pas admirer de trop près, est l’emblème de la faune de la réserve. Aigles royaux, cormorans huppés, faucons pèlerins et colonies de goélands ont également élu domicile à Scandola.